Недавні дослідження вказують на можливість точної діагностики розладів аутистичного спектра (РАС) завдяки аналізу мікробіома кишечника, що включає як бактеріальні, так і небактеріальні компоненти. Ці результати можуть призвести до створення неінвазивного тесту на РАС і відкрити нові терапевтичні можливості, повідомляють науковці під керівництвом Сью С. Нг з Центру мікробіоти (MagIC) Китайського університету Гонконгу. Результати даного дослідження були опубліковані в журналі Nature Microbiology.
Відомо, що мікробіом кишечника відіграє важливу роль у регуляції взаємодії кишечника і мозку, що може впливати на розвиток РАС. Однак більшість досліджень зосереджені на бактеріальній складовій мікробіома, тоді як зміни небактеріальних мікроорганізмів (археї, гриби і віруси) залишаються недостатньо вивченими.
Для дослідження вчені провели метагеномне секвенування зразків дефекації 1627 дітей віком від 1 до 13 років з РАС і без нього з п’яти когорт у Китаї. Ураховуючи фактори дієти, прийому ліків і супутніх захворювань, вони виявили зміни в 14 археях, 51 бактерії, 7 грибах, 18 вірусах, 27 мікробних генах і 12 метаболічних шляхах у дітей з РАС.
Моделі машинного навчання, засновані на даних по археях, бактеріях, грибах і вірусах, досягли показників точності від 0,68 до 0,87 при диференціації дітей з РАС від нейротипових дітей. Модель, що використовує 31 багатофакторний і функціональний маркер, продемонструвала високу точність, досягаючи 0,91, незалежно від статі дітей.
Точність моделей у значній мірі була обумовлена шляхами біосинтезу убіхінолу-7 і тіаміндифосфату, які менш поширені у дітей з РАС і можуть слугувати новими терапевтичними цілями.
Доктор Бхішмадев Чакрабарти, науковий директор Центру аутизму при Університеті Редінга, відзначив важливість цього дослідження, оскільки воно включає широкий спектр мікроорганізмів, а не лише бактерій, і підтверджує попередні дані про зниження мікробного різноманіття у аутичних людей.
Хоча це дослідження може відкрити нові шляхи для діагностики РАС, воно не дозволяє оцінити причинно-наслідкову роль мікробіоти у розвитку аутизму, підкреслив доктор Чакрабарти.
Дослідження було підтримано різними фондами і урядом Гонконгу. Доктор Нг зазначила свої зв’язки з різними фармацевтичними компаніями та патентні інтереси, тоді як доктор Чакрабарти заявив про відсутність конфліктів інтересів.